新疆大学计算机科学与技术学院（以下简称计算机学院）组建于2001年，是新疆维吾尔自治区信息科学领域办学规模最大、层次最高的人才培养基地，是新疆大学“211工程”六个重点建设单位之一，是新疆唯一同时拥有信息类专业博士和硕士点的单位。信息学院建院宗旨，是为了迎接信息技术革命挑战，适应我国中西部以及周边中西亚地区经济发展和信息技术研究需要，加速各族信息技术高层次人才培养，为将新疆大学建成“西部先进，中亚一流，国际知名”的高水平大学做出我们应有的贡献。

计算机学院现有计算机应用技术博士学位授权点,计算机科学与技术博士后流动站；通信与信息 系统、计算机应用技术、计算机软件与理论和信号与信息处理4个硕士学位授权点；计算机技术和电子通信技术两个工程硕士授权点；电子信息工程、通信工程、计算机科学与技术、信息安全和网络工程5个本科专业。

新疆大学计算机科学与技术学院于2001年由原新疆大学电子信息科学系、计算机科学系、计算中心、原新疆工学院计算机工程系以及计算中心组建成立。

为适应新疆电子与信息科学技术的快速发展对人才的迫切需求和新疆大学自身学科发展的需要，1993正式组建了新疆大学电子系。

1988年，从原数学系计算数学专业成立计算机科学与技术学士学位点，1993年成立计算机应用技术硕士点、计算机软件与理论硕士学位点。

2001年学院成立之后，在“211”工程支持下，2006年成立计算机应用技术博士学位点、2007年成立计算机应用技术博士后流动站、2011年成立计算机技术硕士点，从而形成了从学士、硕士、博士、博士后的完整培养体系。

2009年，计算机科学与技术学院“新疆大学多语种信息技术重点实验室”被批准成立为自治区重点实验室。

2010年，计算机科学与技术学院计算机应用技术、信息与通信工程学科入选自治区重点学科。

2011年12月8日,我校计算机科学与技术学院吾守尔·斯拉木教授当选中国工程院院士,成为新疆高校的第一位院士,也是我校自己培养出的第一位院士。

2012年，计算机科学与技术学院获得国家“一省一校”工程（中西部高校综合实力提升工程）的资助。

2013年，计算机科学与技术学院贾振红教授入选国家“百千万人才工程”。

2013年，“计算机科学与技术”本科专业入选“卓越工程师教育培养计划”。

2014年，计算机科学与技术学院贾振红教授进入国家高层次人才特殊支持计划后备人选。

2016年，计算机科学与技术学院计算机科学与技术入选自治区高峰学科计划、信息与通信工程学科入选自治区高原学科计划。

2016年，计算机科学与技术学院通信工程专业入选自治区普通高校第一批重点专业建设特色品牌专业计划，信息安全专业入选自治区普通高校第一批战略新兴专业计划。

2017年，获批计算机科学与技术一级学科博士学位授予权，硕士学位授予权；计算机科学与技术学科成为新疆大学“双一流”建设重点学科；信息学院成为新疆大学“双一流”建设计算机学科群牵头单位。

2018，新疆大学网络空间安全学院成立。

2019年，新疆大学人工智能创新团队清华指导委员会成立；新疆大学人工智能研究院依托学院成立；计算机科学与技术、电子信息工程入选“双万计划”（国家级），信息安全专业入选“双万计划”（自治区级）。

2021年通信工程、信息安全获批国家级一流本科专业建设点。

2021年，学院整体搬迁至博达校区，启用信息技术综合实验楼。

2022年计算机科学与技术学科入选第二轮国家一流建设学科。